Pri experimentálnej analýze proteínov metódou hmotnostnej spektrometrie sa získavajú základné údaje o identifikovaných proteínoch študovaného biologického organizmu. Výstupom experimentálneho merania sú údaje z proteomických databáz limitované rozsahom formátu FASTA, ktoré sú doplnené vybranými výsledkami samotného experimentálneho merania. Súčasťou spracovania a vyhodnotenia výsledkov je manuálne vyhľadávanie ďalších údajov o jednotlivých proteínoch v dostupných elektronických databázach.

Na automatizáciu týchto činností bol vyvinutý softvérový nástroj ADprot, ktorý umožňuje:

• automatizované vyhľadávanie vybraných údajov z voľne dostupných proteínových databáz UNIPROT a NCBI, ich integráciu s experimentálnymi výsledkami získanými hmotnostnou spektrometriou a ukladanie do lokálnej databázy
• načítavanie a aktualizáciu vybraných údajov o proteínoch získaných z  proteínových databáz UNIPROT a NCBI
• načítavanie experimentálnych údajov o proteínoch identifikovaných hmotnostnou spektrometriou, vrátane sekvencií peptidov, podľa ktorých boli jednotlivé proteíny v meraniach identifikované
• generovanie výstupnej zostavy v rôznych formátoch
• možnosť ukladania dát na databázový server alebo lokálne v súborovom systéme

ADprot bol vyvinutý v spolupráci s Virologickým ústavom SAV.